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    facet.materialart.
    Unbekannt
    Multicanonical Approach in Statistical Mechanics of Peptides (1994)
    Details
    Publikationsdatum: 2014-02-26
    Beschreibung: We test the performance of the multicanonical approach for biological molecules. The simulated molecules are frustrated systems with a complicated energy landscape. The resulting slowing down in simulations is alleviated by our ansatz. We perform a multicanonical simulation of nonpolar amino acids and study their $\alpha$-helix propensities. The results are shown to be in agreement with recent experimental results.
    Schlagwort(e): ddc:000
    Sprache: Englisch
    Materialart: reportzib , doc-type:preprint
    Format: application/postscript
    Format: application/pdf
    Bibliothek Standort Signatur Band/Heft/Jahr Verfügbarkeit
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    OPUS
  • 2
    facet.materialart.
    Unbekannt
    Comparative Study of Multicanonical and Simulated Annealing Algorithms in the Protein Folding Problem. (1994)
    Details
    Publikationsdatum: 2014-02-26
    Beschreibung: We compare a few variants of the recently proposed multicanonical method with the well known simulated annealing for the effectiveness in search of the energy global minimum of a biomolecular system. For this we study in detail Met-enkephalin, one of the simplest peptides. We show that the new method not only outperforms simulated annealing in the search of the energy groundstate but also provides more statistical-mechanical information about the system.
    Schlagwort(e): ddc:000
    Sprache: Englisch
    Materialart: reportzib , doc-type:preprint
    Format: application/postscript
    Format: application/pdf
    Bibliothek Standort Signatur Band/Heft/Jahr Verfügbarkeit
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    OPUS
  • 3
    facet.materialart.
    Unbekannt
    Towards Ab Initio Prediction of Protein Conformations - The Multicanonical Approach. (1994)
    Details
    Publikationsdatum: 2014-02-26
    Beschreibung: We demonstrate the effectiveness of the multicanonical algorithm for the tertiary structure prediction of peptides and proteins. Unlike to simulated annealing the relationship to the canonical ensemble remains exactly controlled. Hence, the new method allows not only the prediction of the lowest-energy conformation, but also the calculation of thermodynamic quantities at various temperature from one run.
    Schlagwort(e): ddc:000
    Sprache: Englisch
    Materialart: reportzib , doc-type:preprint
    Format: application/postscript
    Format: application/pdf
    Bibliothek Standort Signatur Band/Heft/Jahr Verfügbarkeit
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