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  • 1
    Electronic Resource
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    New York, NY : Wiley-Blackwell
    International Journal of Quantum Chemistry 2 (1968), S. 463-470 
    ISSN: 0020-7608
    Keywords: Computational Chemistry and Molecular Modeling ; Atomic, Molecular and Optical Physics
    Source: Wiley InterScience Backfile Collection 1832-2000
    Topics: Chemistry and Pharmacology
    Description / Table of Contents: Les méthodes Hückel MO et SCF-ASMO-CI (sémi-empirique) ont été employées pour calculer des énergies de transition de sept tautoméres possibles de la flavine et de deux imino-flavines (bases de Schiff). Les énergies de transition calculées indiquent que la tautomérie et la formation de bases de Schiff sont accompagnées d'un déplacement bathochrome par rapport au spectre d'absorption de la riboflavine. Ce déplacement est particuliérement prononcé dans le cas des formes énoliques de la molécule d'isoalloxazine. Les tautomères énoliques ont aussi ses niveaux triplets les plus bas bien au-dessous des triplets des autres tautomères. On discute la signification de ces résultats.
    Abstract: Die Hückelsche MO-Methode und die halb-empirische SCF-ASMO-CI-Methode wurden für die Berechnung der Übergangsenergien sieben möglicher Flavintautomeren und zwei Iminoflavinen (Schiffscher Basen) benützt. Die berechneten Übergangsenergien zeigen dass die Tautomerie und die Bildung Schiffscher Basen mit einer bathochromischen Verschiebung hinsichtlich des Absorptionsspektrums des Riboflavins verbunden ist. Diese Verschiebung ist im Falle der 4-Enolformen des Isoalloxazinmoleküls besonders ausgeprägt. Die 4-Enoltautomere haben auch tiefste Triplettniveaus wohl unter den Tripletten anderer Tautomeren. Die Bedeutung dieser Resultate wird diskutiert.
    Notes: The Hückel MO and semiempirical SCF-ASMO-CI methods have been employed to calculate transition energies of seven possible flavin tautomers and two imino flavins (Schiff bases). The calculated spectral transition energies indicate that the tautomerism and Schiff base formation are accompanied by a bathochromic shift with reference to the absorption spectrum of riboflavin. This shift is especially pronounced in the case of the 4-enol forms of the isoalloxazine molecule. The 4-enolic tautomers also have lowest triplet levels well below the triplets of other tautomers. The significance of the results has been discussed.
    Additional Material: 2 Ill.
    Type of Medium: Electronic Resource
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 2
    ISSN: 0020-7608
    Keywords: Computational Chemistry and Molecular Modeling ; Atomic, Molecular and Optical Physics
    Source: Wiley InterScience Backfile Collection 1832-2000
    Topics: Chemistry and Pharmacology
    Description / Table of Contents: Les réactions de la 2-chloropurine et d'autre bases, catalysées par la xanthine oxidase, ont été étudiées avec des méthodes différentes basées sur l'idée des orbitales molécularies, telles que HMO, ω-SCF—HMO, et PPP. Ces études not démontré l'importance des indices de réactivité électronique pour comprendre les réactions d'enzymes. De plus il paraît possible de prédire la spécificité de l'enzyme d'une analyse systématique de la différence entre les sites de réactions prédits et observés dans des substrats avec des substituants 2- et 8-oxy.Les concepts de densité d'obritale de frontière, de superdélocalisabilité et d'énergie de localisation se sont avérés tres utiles. Les Méthodes différentes ont donné en général dees résultats consistants.
    Abstract: Ein genauses Studium der durch Xanthine-Oxidas katalysierten Reaktionen von 2-Chloropurin und anderen Basen mittels verschiedenen MO-Methoden, wie HMO, ω-SCF—HMO, PPP, zeigt dass die Enzymreaktionen in der Sprache von elektronischen Reaktivitätsindizes beschrieben werden können. Es scheint möglich das Enzymspezifizität von einer systematischen Analysis der Verschiedenheit zwischen theoretisch berechnbeten und observierten Reaktionslagen in Substraten Mit 2- und 8-oxy Substituenten vorherzusagen.De Regriffe der Grenzorbitaldichte, des Superdelokalisabilitäts und der Lokalisierungsenergie sind sich sehyr nützlich rewiesen. Verschiedence MO-Methoden gaben im allgemeinen übereinstimmende Resultate.
    Notes: A detailed study to the xanthine oxidase-catalyzed reactions of 2-chloropurine and other substrate bases with various molecular-orbital techniques such as HMO, ω-SCF—HMO, and ppp semiempirical SCF—LCAO—MO has shown that the enzyme reactions can be understood in terms of electronic reactivity indices. Furthermore, it appeared possible to suggest the enzyme specificity from a systematic analysis of discrepancy between mo theoretically predicted and observed reaction sites in substrates with 2- and 8-oxy substituents. In other words, the discrepancy does not necessarily indicate the failure of the MO melthodes for such substrates, but it is possible to utilize the result in correlating with binding specificity of the ES complex. This has been done specifically for 2-chloropurine.Among several electronic reacxtivity indices, frontier orbital density, superdelocalizability, and localization energy have been proved to be very useful. Diferent MO methods gave, in general, consistent results.
    Additional Material: 6 Ill.
    Type of Medium: Electronic Resource
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 3
    ISSN: 0020-7608
    Keywords: Computational Chemistry and Molecular Modeling ; Atomic, Molecular and Optical Physics
    Source: Wiley InterScience Backfile Collection 1832-2000
    Topics: Chemistry and Pharmacology
    Description / Table of Contents: Les calculs HMO généralisé (EHMO) et Pople-Segal SCF-MO-CNDO/2 sur la purine, la 8-oxopurine, la 2-oxopurine, la 2-fluoropurine, et la 2-chloropurine indiquent qu'il y a des polarisations importantes dans les coeurs σ. On démontre que les polarisations des squeĺettes π et σ s'opposent mutuellement dans certains cas. Les résultats des deux méthodes sont comparés pour ces biomolécules-ci. On trouve que les calculs EHMO ont une tendance é exagérer la polarisation des squelettes π et σ. Des calculs CNDO il résulte des densités π abinakes syr N(7) et C(8) des anneaux de la purine; la raison de cette anomalie n'est pasconnue.
    Abstract: Die verallgemeinerten HMO (EHMO) und Pople-Segal SCF-MO-CNDO/2-Berechnungen fü Purin, 8-Oxopurin, 2-Oxopurin, 2-Fluoropurin, und 2-Chloropurin zeigen bedeutsame Polarisationen in den σ-Gerüsten. Es wird gezeigt, dass die Polarisationen der π- und σ-Gerüste in gewissen Fallen entgegensetzt snd. Die resultate der beiden Methoden Werden für diese Biomoleküle verglichen. Man findet dass die EHMO-Berechnungen eine Tendenz haben die Polarisation der π- und σ-Gerüste zu übertreiben. Die CRMO-Berechnung gibt anomale π-Elektronendichten auf N(7) und C8 der Purinringe; die Ursache dieser Anomalie ist nicht bekannt.Die Anwendung der Resultate auf das Xanthin-Oxidase-System zeigt dass die Substratmoleküle einer besonderen Orientierung auf der Enzymoberfläche unterworfen sind, was der elektronischen Reaktivität zuwiderhandelt. Dieses stimmt mit der Vorhersage der π-Elektronen-berechnungen überein. In diesem Fall scheinen die CNDO-Resultate befriedigender als die der EHMO-Berechnungen zu sein.
    Notes: The extended HMO (EHMO) and Pople-Segal SCF-MO-CNDO/2 calculations on purine, 8-oxopurine, 2-oxopurine, 2-fluoropurine, and 2-chloropurine indicate significant polarizations of the σ cores. It is shown that the polarizations of both σ and π frameworks are mutually opposing in some cases. The results from the two methods are compared for these complex biomolecules. It is found that the EHMO calculations tend to over-polarize the σ and π frameworks. However, the CNDO shows anomalous π-electron densities on N(7) and C(8) of the purine rings, and the reason for this anomaly is not certain.The application of the results to the xanthine oxidase system indicates that the substrate molecules are subject to a specific orientation on the enzyme surface to counteract the electronic reactivity, in support of the previous prediction based on the π-electron calculations. The CNDO results appear to be more satisfactory than the EHMO in this respect.
    Additional Material: 1 Ill.
    Type of Medium: Electronic Resource
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 4
    ISSN: 0020-7608
    Keywords: Computational Chemistry and Molecular Modeling ; Atomic, Molecular and Optical Physics
    Source: Wiley InterScience Backfile Collection 1832-2000
    Topics: Chemistry and Pharmacology
    Notes: Methyl groups in flavins are best treated by the group-orbital approximation. The pseudo-heteroatom approximation overestimates methyl hyperconjugation with the Pariser-Parr-Pople SCF-MO method. Singlet π → π* transition energies are calculated by various MO methods with differing degrees of sophistication, and the results from the P—P—P method agree reasonably with the experimental values. 2- and 4-thioflavin analogs are also treated satisfactorily. The effects of position and number of the methyl groups on the spectra of flavins are described in detail. Rough estimates of the n → π* energies of flavins suggest that the lowest singlet excited state is (π, π*), consistent with the fluorescence and phosphorescence polarization data.
    Additional Material: 3 Ill.
    Type of Medium: Electronic Resource
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 5
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    New York, NY : Wiley-Blackwell
    International Journal of Quantum Chemistry 2 (1968), S. 281-296 
    ISSN: 0020-7608
    Keywords: Computational Chemistry and Molecular Modeling ; Atomic, Molecular and Optical Physics
    Source: Wiley InterScience Backfile Collection 1832-2000
    Topics: Chemistry and Pharmacology
    Description / Table of Contents: Les structures éectroniques et les spectres de la 2-chloropurine héterocyclique, non-alternante et de ses analogues ont été calculés par des méthodes MO différentes: HMO, ω-SCF-HMO (ω=1.4 et 0.5), et PPP-SCF-ASMO-CI. Les énergies des états triplets ont été calculé es au moyen de la derniére méthode. On trouve en général, au moins du point de vue “sémi-quantitatif”, des résultats consistants pour les propriétés de 1'état fondamental, en comparant les méthodes différentes. Les états excités des molécules ne sont pas traités en comparant les méthodes différentes. Les états excités des molécules ne sont pas traités d'une maniére satisfaisante par les méthodes HMO et ω-SCF, ce qui était prévu. Cependant la méthode PPP donne un accord excellent entre les énergies de transition π-π* observéeset calculées. II nous semble que la consistance “sémi-quantitative” des propriétés de 1' état fondamental justifie 1'application limitée en biologie moléculaire des méthodes simples comme HMO et ω(=0.5)-SCF.Les résultats sur la géométrie moléculaire, les moments dipolaires, les potentiels d'ionization, la reactivité de la xanthine oxidase et les spectres ont été discutés en tenant comtedes substitutions halogénoides dans la base purique. L'importance de ces résultats-ci pour I'emploi biologique des purines substitutées a été discutée briévement.
    Abstract: Elektronstrukturen und Spektra nicht-alternierendes, heterozyklisches 2-chloropurins und analoger Moleküle wurden mit verschiedenen MO-Methoden: HMO, ω-SCF-HMO (ω =1.4 und 0.5), und PPP-SCF-ASMO-CI, berechnet. Die Energien der Triplettzustäade wurden mit der letzten Methode berechnet. Im allgemeinen findet man für die Eigenschaften des Grundzustands, dass die Resultate der verschiedenen Methoden wenigstens in “semi-quantitativer” Weise übereinstimmend sind. Wiie erwarter werden die angeregten Zustände der Moleküle nicht in befriedigender Weise mit den HMO- and ω-Methoden behandelt. Eine vortreffliche Übereinstimmung zwischen den beobachteten und berechneten π-π*- Übergangsenergien wurde aber in der PPP-Methode erhalten. Im Hinblick auf die “semiquantitative” Übereinstimmung der Eigenschaften des Grundzustands scheint es rechtgefertigt einfache Methoden wei HMO und ω(= 0.5)-SCF für begrenzte Anwendungen in Molekularbiologie zu benutzen.Die Resultate für die molekulare Geometrie, die Dipolmomente, die Ionisierungsspannungen, die Xanthine-Oxidas-Reaktivität und die Spektra wurden im Hinblick auf Halogensubstitutionen in der Purinbasen diskutiert. Die Bedeutung dieser Resultate für die biologische Anwendung substituierter Purine wird kürzlich beschrieben.
    Notes: Electronic structures and spectra of “non-alternant” heterocyclic 2-chloropurine and its analogs have been computed with different MO techniques, namely, HMO, ω-SCF-HMO (ω = 1.4 and 0.5), and PPP semiempirical SCF-ASMO-CI. Triplet-state energies have been calculated by the last method. In general, it is found that at least semiquantitatively consistent results on the ground-state properties of the molecules are obtained from the different MO methods. As expected, excited states of the molecules are not satisfactorily treated by the HMO and σ techniques. However, an excellent agreement between the observed and calculated π-π* transition energies has been obtained with the PPP method. In view of the semiquantitative consistency of the ground-state properties, the use of simple methods such as HMO and ω(=0.5)-SCF techniques is justifiable for limited application to molecular biology.Results on the molecular geometry, dipole moments, ionization potentials, xanthine oxidase reactivity and spectra have been discussed with regard to the halogen substitutions in the purine base. The significance of these results with reference to the biological uses of substituted purines is briefly described.
    Additional Material: 3 Ill.
    Type of Medium: Electronic Resource
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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