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  • 1
    Electronic Resource
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    Palo Alto, Calif. : Annual Reviews
    Annual Review of Biochemistry 55 (1986), S. 773-799 
    ISSN: 0066-4154
    Source: Annual Reviews Electronic Back Volume Collection 1932-2001ff
    Topics: Chemistry and Pharmacology , Biology
    Type of Medium: Electronic Resource
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 2
    ISSN: 1432-203X
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Biology
    Notes: Summary The RAPD procedure was used to establish genetic diversity of 28 potato genotypes including siblings and genotypes with no immediate relationship. In addition amplified DNA from three parents and Solanum chacoense were compared with that from six progeny to determine the genetic relationships. Amplification of genomic DNA from the 28 genotypes using PCR and 12 decamer primers yielded 158 amplified DNA fragments, ranging in size from 490 to 3200 bp. A total of 128 unique RAPD fragments were observed among the 28 potato genotypes. Similarity measures and principal coordinate analysis generally reflected the expected trends in relationships of the full and half-sib potato genotypes. However there were important exceptions to this general trend and it appears that related varieties can be as genetically different as varieties with no immediate relationship. The data suggest that RAPD analysis used in conjunction with pedigree information can provide a superior measure of genetic divergence than analysis based solely on pedigree information.
    Type of Medium: Electronic Resource
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 3
    ISSN: 1432-203X
    Keywords: Abbreviations: PCR: polymerase chain reaction; RAPD: random amplified polymorphic DNA; DNA: deoxyribonucleic acid; CTAB: cetyltrimethylammonium bromide; RNA: ribonucleic acid; PCO: principal coordinate analysis
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Biology
    Notes: Summary. The RAPD procedure was used to establish genetic diversity of 28 potato genotypes including siblings and genotypes with no immediate relationship. In addition amplified DNA from three parents and Solanum chacoense were compared with that from six progeny to determine the genetic relationships. Amplification of genomic DNA from the 28 genotypes using PCR and 12 decamer primers yielded 158 amplified DNA fragments, ranging in size from 490 to 3200 bp. A total of 128 unique RAPD fragments were observed among the 28 potato genotypes. Similarity measures and principal coordinate analysis generally reflected the expected trends in relationships of the full and half-sib potato genotypes. However there were important exceptions to this general trend and it appears that related varieties can be as genetically different as varieties with no immediate relationship. The data suggest that RAPD analysis used in conjunction with pedigree information can provide a superior measure of genetic divergence than analysis based solely on pedigree information.
    Type of Medium: Electronic Resource
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 4
    Electronic Resource
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    Springer
    Plant cell reports 9 (1991), S. 607-610 
    ISSN: 1432-203X
    Keywords: Toxic metabolites ; Early blight ; Tuber discs ; Regeneration capacity
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Biology
    Notes: Summary The effect of Alternaria solani culture filtrate on adventitious shoot regeneration from tuber discs was evaluated using five potato cultivars, which were selected based on their field reaction to Alternaria solani and which represented a range of disease reactions. The culture filtrate stimulated regeneration, a response that could prove to be very useful in the wider utilization of transformation and in vitro selection technology.
    Type of Medium: Electronic Resource
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 5
    ISSN: 1432-2242
    Keywords: Verticillium dahliae ; Random amplified polymorphic DNA (RAPD) ; Codominant DNA polymorphism ; Lycopersicon esculentum
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Biology
    Notes: Abstract Resistance to verticillium wilt, a vascular disease causing yield losses in many crops, is conferred in tomato by a single dominant allele, Ve. A population segregating for the Ve allele was generated using near-isogenic tomato lines. Analysis of the parental tomato DNA using the polymerase chain reaction and 400 random primers, each 10 deoxyribonucleotides in length, produced 1,880 amplified DNA fragments. Of the four polymorphisms observed between the resistant and susceptible parental genotypes, only one was linked to the Ve gene. No recombination was observed between this DNA marker and the Ve locus, indicating that the linkage is less than 3.5±2.7 cM. The marker detected both the susceptible and resistant alleles, producing amplified DNA fragments of approximately 1,300 and 1,350 bp, respectively. The sequence of the primer, determined from cloned amplified products, was 5′ CTCACATGCA 3′ instead of the expected 5′ CTCACATGCC 3′. The marker will be of value to tomato breeding programs because of the tight linkage, Codominant nature, and analytical procedure utilized.
    Type of Medium: Electronic Resource
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 6
    ISSN: 1871-4528
    Keywords: experimental design ; control plots ; adjustment ; yield trials ; potato ; breeding
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Agriculture, Forestry, Horticulture, Fishery, Domestic Science, Nutrition
    Description / Table of Contents: Zusammenfassung Selektion bei frühen Generationen in Kartoffelzüchtungsprogrammen beruht auf hochvererbbaren Merkmalen, wie Augentiefe, Knollengestalt, Chipsfarbe, spezifischem Gewicht etc. Weitere Selektion betont Adaption an Umgebungen innerhalb des Schwerpunktes des Zuchtprogrammes und in diesem Selektionsstadium wird grösser Aufmerksamkeit auf den Knollenertrag gerichtet. Allerdings verbietet die grosse Zahl oft einbezogener Linien, zusammen mit der begrenzten Verfügbarkeit an Material von jeder Linie, die Anwendung von Standardmodellen mit Wiederholungen. Das modifizierte erweiterte Modell (MAD), kürzlich von Lin u. Poushinsky (1983) als Methode zur Anpassung von umweltbedingter Heterogenität vorgeschlagen, wurde in Adaptionsversuchen des ‘Prairie Cooperative Kartoffelzuchtprogramms’ (Kanada, 1982) an vier Stellen erprobt. In dem MAD werden Kontrollsorten, die in Mengen erhältlich sind, welche Wiederholungen erlauben, zufallsgemäss auf eine Gruppe ganzer Parzellen verteilt, die in einem Standardmuster ausgelegt sind, hier als Lateinisches Quadrat (Abb. 1). Anpassungen für die Testlinien erfolgen auf der Basis von Trends, die sich in den Kontrollparzellen ergeben. Die Daten der Kontrollparzellen werden entsprechend der Varianzanalyse (ANOVA) für das Lateinische Quadrat geprüft. Wenn Säulen- und Reiheneffekte zum gesamten Parzellenfehler relativ gross sind, werden die nicht wiederholten Testlinien anhand der Reihen-und/oder Säulenkorrekturen nach Schätzung der Kontrollparzellen berichtigt (Methode 1). Wenn Bodenunterschiede dadurch nicht eliminiert werden können, dient ein Index für Nährstoffgehalt für jede Parzelle, als Differenz zwischen dem Wert der Kontrollparzelle für diese gesamte Parzelle und dem Mittel aller Kontrollparzellen mit der entsprechenden Sorte entweder als Anpassungsfaktor (Methode 2), oder wird als begleitende Variable behandelt und die Testlinien werden durch Kovarianzanalyse berichtigt (Methode 3). Der durchschnittliche Gesamtertrag und die mittleren Quadrate, in der ANOVA als Gesamtertrag der Kontrollparzellen an den vier Versuchsorten, ergibt sich aus Tabellen 1 bzw. 2. Die Reihen- und Säulenvarianzen waren gross (im Verhältnis zum Gesamt-Parzellenfehler) für Edmonton I und II und für Brooks II, sie deuten auf die Notwendigkeit für Reihen- und Säulenanpassungen hin. Eine Prüfung der Irrtumsvarianzen für Carman I und II, möglicherweise auch Brooks I zeigen starke Heterogenität in mehrere Richtungen zwischen den Parzellen, zumal die ganzen Varianzen der Parzellen grösser als die doppelte Höhe der Unterparzellen-Varianzen waren. Bei Outlook war keine der Varianzen relativ gross gegenüber den anderen. Diese Trends erklären die Anpassungsmethode 1 für Edmonton I und II, die Anpassungsmethode 3 für Carman I und II und Brooks I und II, und keine Anpassung bei Outlook I. Detaillierte Kriterien zur Entscheidung für die angemessene Anpassungsmethode wurden im Computer verrechnet. Die durchschnittlich geschätzte Varianz einer Differenz zwischen beliebigen zwei Testlinien wurden für jede Methode berechnet, dann wurden die Methoden durch Berechnung der Verhältnisse dieser Varianzen ermittelt (Tabelle 3). Ebenso wurden die Methoden durch Anwendung der Anpassungen an die Kontroll-Unterparzelle und druch Berechnung der gepoolten Varianzen innerhalb der Linien von angepassten Daten (Tabelle 4) verglichen. Die relativen Effizienzen der Anpassungsmethoden wurden als Verhältnisse der Varianz der nichtangepassten Daten zu den angepassten Daten berechnet. Die Varianzdaten in Tabelle 4 zeigen, dass im allgemeinen die Anpassung durch Regressionsanalyse (Methode 3) sich entweder durch geringfügige Änderungen oder durch beträchtlichen Gewinn an Effizienz auswirkten. Ausser bei Edmonton I verursachten die Methoden I und II einen deutlichen Anstieg in der gepoolten Varianz innerhalb der Linien und folglich einen Verlust an Effizienz. Das wichtige Ergebnis der Anpassung bei der Selektion von Zuchtmaterial sind die Änderungen bei den relativen Schwankungen in der Rangfolge der Testlinie. Diese Änderungen, nach Verwendung der drei Anpassungsmethoden verrechnet, zeigt Tabelle 5. Verwendung ungeeigneter Testmethoden ergibt oft sehr grosse, wahrscheinlich auch unechte Rangfolge-Änderungen. Die Leichtigkeit der Anwendung und die Möglichkeit nachzuforschen sowie der groberen Anpassungen wegen umweltbedingter Heterogenität machen das Modell sehr geeignet für den Gebrauch in frühen Stadien von Kartoffel-Züchtungsprogrammen.
    Abstract: Résumé La sélection des premières générations dans les programmes d'hybridation de la pomme de terre est basée sur la haute héritabilité des caractères tels que la profondeur des yeux, la forme des tubercules, la couleur après friture, le poids spécifique, etc. Plus tard, la sélection met l'accent sur l'adaptation aux conditions d'environnement et, à ce stade, la plus grande attention est apportée au rendement. Cependant, un grand nombre de lignées est souvent impliqué et le matériel disponible pour chaque lignée est limité, empêchant des répétitions conformément au modèle standard d'expérimentation. Le modèle modifié (MAD) récemment proposé par Lin et Poushinsky (1983) comme méthode d'ajustement de l'hétérogénéité a été adapté dans des essais réalisés par le Prairie Cooperative Potato Breeding Program (Canada) en 1982 sur quatre localités. Dans le MAD, le contrôle des variétés disponibles en quantité permettant les répétitions est randomisé en une série de parcelles établies selon un modèle standard, ici un Carré Latin (figure 1). Pour les lignées-tests, les ajustements sont faits sur la base des valeurs fournies par les parcellestémoins, après une analyse de variance (ANOVA) adaptée au Carré Latin. Si les effets du rang et de la colonne sont grands par rapport à l'erreur de la parcelle entière, les valeurs des lignées-tests sans répétition sont ajustées en utilisant les corrections rang et/ou colonne estimées à partir des parcelles-témoins (méthode 1). Si l'effet de l'hétérogénéité du sol ne peut être éliminé par ce procédé, un index de fertilité pour chaque parcelle entière, évalué comme la différence entre la valeur de cette parcelle et la valeur moyenne de toutes les parcelles-témoins des autres variétés, est utilisé comme facteur d'ajustement (méthode 2) ou est traité comme une variable concomitante et les valeurs des lignées-tests sont alors ajustées par l'analyse de covariance (méthode 3). La moyenne du rendement total en tubercules et les carrés moyens du rendement total des parcelles-témoins des quatres localités d'essais, calcultés par l'ANOVA, sont présentés respectivement dans les tableaux 1 et 2. Les variances du rang et de la colonne sont grands (relativement à la parcelle entière) pour Edmonton I et II et pour Brooks II, suggérant la nécessité d'ajustements. L'observation des variances de l'erreur de Carman I et II et probablement de Brooks I montre une forte hétérogénéité multidirectionnelle entre parcelles puisque les variances des parcelles entières sont deux fois plus grandes que celles des sous-parcelles. Pour Outlook, aucune des variances n'est élevée par rapport à chacune des autres. Ces résultats suggèrent l'emploi d'un ajustement de type méthode 1 pour Edmonton I et II, de type méthode 3 pour Carman I et II, Brooks I et II et pas d'ajustement pour Outlook I. Des critères détaillés pour décider de la méthode d'ajustement à utiliser ont été étudiés. La variance moyenne estimée entre deux lignées-tests a été calculée pour chaque méthode et les méthodes ont été comparées en calculant les rapports de ces variances (tableau 3). Elles ont été aussi comparées par application des ajustements aux sousparcelles-témoins et pour l'ensemble des données ajustées au sein de chaque lignée (tableau 4). L'efficacité relative des méthodes d'ajustement a été calculée comme un rapport entre la variance de la donnée non ajustée et celle de la donnée ajustée. La variance de la donnée présentée dans le tableau 4 indique qu'en général l'ajustement par l'analyse de régression (méthode 3) provoque un petit changement ou cause un gain substanciel d'efficacité. Excepté pour Edmonton I, l'ajustement par les méthodes I et 2 apporte une augmentation marquée de la variance de l'ensemble interlignées, donc une perte d'efficacité. Les résultats importants de l'ajustement dans la sélection du matériel d'hybridation modifient le classement relatif des lignées-tests. La modification de ce classement, apportée par les trois méthodes d'ajustement est présentée dans le tableau 5. L'emploi des méthodes d'adjustement inappropriées conduit vraisemblablement souvent à des modifications de classement erronées. La facilité d'utilisation et la capacité d'investigation pour déceler l'hétérogénéité due aux conditions d'environnement fait de ce modèle un outil bien souhaitable durant les premiers stades du programme d'hybridation de la pomme de terre.
    Notes: Summary The modified augmented design, recently proposed as a method of adjusting for environmental heterogeneity where large numbers of cultivars are being tested in non-replicated plots, was used in a potato breeding programme at four locations in 1982. Of three methods of adjusting for soil variation, only the row-column and covariance adjustments worked efficiently. Decisions about which adjustment method to use could be based on easily computed mean squares. Changes in ranking due to adjustment of test cultivars were large in three of the seven trials, but application of inappropriate adjustment methods produced large and misleading ranking changes in some trials. Because of ease of use and ability to investigate environmental variation, the design can be recommended for use in early stages of potato breeding programmes.
    Type of Medium: Electronic Resource
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 7
    ISSN: 1871-4528
    Keywords: breeding clones ; rapid propagation ; tissue culture
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Agriculture, Forestry, Horticulture, Fishery, Domestic Science, Nutrition
    Notes: Summary Apical explants from sprout tissue, cultured in vitro, of potato tubers (cv. Russet Burbank) infected withCorynebacterium sepedonicum were demonstrated to be free of the pathogen. The material remained free of the pathogen through three in vitro generations and through two tuber generations produced from the in vitro plantlets.
    Type of Medium: Electronic Resource
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 8
    ISSN: 1871-4528
    Keywords: detached leaflet assay ; resistant cultivars ; plant maturity
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Agriculture, Forestry, Horticulture, Fishery, Domestic Science, Nutrition
    Notes: Summary The phytotoxic components of the culture filtrate of the fungusAlternaria solani Sor, which causes early blight in potato, were used in this study to differentiate between resistant and susceptible genotypes selected to represent a range of reactions when screened in the field. Detached leaflet assays, using spores and toxic metabolites from the culture filtrate, were compared with field ratings and a whole-plant glasshouse test. Rank correlations between several detached leaflet tests were highly significant (P〈0.01) but the correlations between these tests and the glasshouse and field tests were poor. The disease ratings obtained in the various tests were clustered into four groups and assigned to resistance classes. For many of the genotypes there was a good correspondence between resistance classes for all test methods. Divergent results between tests were associated with foliage maturity characteristics of the genotypes.
    Type of Medium: Electronic Resource
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 9
    Electronic Resource
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    Springer
    Potato research 35 (1992), S. 133-142 
    ISSN: 1871-4528
    Keywords: Corynebacterium sepedonicum ; dwarf-rosetting ; Solanum tuberosum L.
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Agriculture, Forestry, Horticulture, Fishery, Domestic Science, Nutrition
    Notes: Summary Plants were grown in the field from seed pieces of potato cultivars injected with ring rot bacteria (Corynebacterium sepedonicum). Symptoms were produced with both 18 and 180 colony forming units (cfu) on cvs Norchip and Red Pontiac and with 180 cfu on cv. Belrus plants. Tuber symptoms were detected in all cultivars except Belrus and Teton. Tuber progeny produced plants that developed top symptoms on all cultivars except those of cv. Nooksack, Russet Burbank, and Teton. Tuber progeny of the second crop produced both plants and tubers with symptoms developing only in the cv. Nooksack. In another 3-year experiment, variability in the disease response of selected cultivars and lines was examined following knife-inoculation of tuber seed with a high level of ring rot bacteria. Significant correlations between top and tuber symptoms were detected, but they were not high enough to make unnecessary the examination of both top and tuber symptoms in ring rot disease selection studies.
    Type of Medium: Electronic Resource
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 10
    Electronic Resource
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    Springer
    Plant and soil 148 (1993), S. 101-106 
    ISSN: 1573-5036
    Keywords: neutron probe ; neutron count ratio ; neutron probe measurement ; Potato tubers ; soil moisture ; water content
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Agriculture, Forestry, Horticulture, Fishery, Domestic Science, Nutrition
    Notes: Abstract A field study was conducted to examine the effect of the water content of potato tubers on the neutron count ratios of a neutron probe in an irrigated potato field. At the 20 cm depth, where tubers are concentrated, the neutron count ratios within the potato row (CW) were significantly higher than the neutron count ratios between the rows (CB). In contrast, the measured soil water contents within the rows (SW) at this depth, tended to be less than those measured between the rows (SB). At 45 cm depth, results were similar in a dry but not a wet year. The SW values, in contrast, were less than SB. Neither (CW-CB) or (SW-SB) were significant at 75 cm depth and values of (CW-CB) and (SW-SB) were similar. This study provides qualitative information regarding the influence of a potato tuber water content on neutron measurements, resulting in an overestimations of soil moisture in a potato field. Further studies should be conducted to develop relationships for corrections.
    Type of Medium: Electronic Resource
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