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    ISSN: 1432-2234
    Schlagwort(e): Key words: Adaptive umbrella sampling ; Multicanonical sampling ; Helical peptide ; β-hairpin
    Quelle: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Thema: Chemie und Pharmazie
    Notizen: Abstract. Adaptive umbrella sampling of the potential energy is used as a search method to determine the structures and thermodynamics of peptides in solution. It leads to uniform sampling of the potential energy, so as to combine sampling of low-energy conformations that dominate the properties of the system at room temperature with sampling of high-energy conformations that are important for transitions between different minima. A modification of the procedure for updating the umbrella potential is introduced to increase the number of transitions between folded and unfolded conformations. The method does not depend on assumptions about the geometry of the native state. Two peptides with 12 and 13 residues, respectively, are studied using the CHARMM polar-hydrogen energy function and the analytical continuum solvent potential for treatment of solvation. In the original adaptive umbrella sampling simulations of the two peptides, two and six transitions occur between folded and unfolded conformations, respectively, over a simulation time of 10 ns. The modification increases the number of transitions to 6 and 12, respectively, in the same simulation time. The precision of estimates of the average effective energy of the system as a function of temperature and of the contributions to the average effective energy of folded conformations obtained with the adaptive methods is discussed.
    Materialart: Digitale Medien
    Bibliothek Standort Signatur Band/Heft/Jahr Verfügbarkeit
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    Digitale Medien
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    Weinheim : Wiley-Blackwell
    Zeitschrift für anorganische Chemie 606 (1991), S. 73-78 
    ISSN: 0044-2313
    Schlagwort(e): Complexes of tetraselenium-dinitride ; syntheses ; IR-spectra ; 119Sn-Mössbauer spectrum ; Chemistry ; Inorganic Chemistry
    Quelle: Wiley InterScience Backfile Collection 1832-2000
    Thema: Chemie und Pharmazie
    Beschreibung / Inhaltsverzeichnis: Donor-Acceptor Complexes [SnCl4(Se4N2)2] and [TiCl4(Se4N2)]The donor-acceptor complexes [SnCl4(Se4N2)2] and [TiCl4(Se4N2)] have been prepared by the reactions of Se4N2 with SnCl4 and TiCl4, respectively, in CH2Cl2 suspensions, forming red-brown, moisture sensitive crystal powders. The complexes are characterized by i. r. spectroscopy, the tin compound additionally by 119Sn Mössbauer spectroscopy. According to the spectra, in the tin complex both Se4N2 molecules are bonded with one of the nitrogen atoms at the tin atom in transposition (symmetry Ci), whereas in the titanium complex we assume both nitrogen atoms to be bonded in a chelating fashion at the titanium atom.
    Notizen: Die Donorakzeptorkomplexe [SnCl4(Se4N2)2] und [TiCl4(Se4N2)] werden aus den Komponenten Se4N2 und SnCl4 bzw. TiCl4 in CH2Cl2-Suspensionen in Form rotbrauner, feuchtigkeitsempfindlicher Kristallpulver hergestellt. Die Komplexe werden durch ihre IR-Spektren, die Zinnverbindung zusätzlich durch das 119Sn-Mößbauer-Spektrum charakterisiert. Danach sind die Se4N2-Moleküle in der Zinnverbindung in trans-Position über je ein N-Atom an das Zinnatom koordiniert (Symmetrie Ci), während in dem Titankomplex vermutlich beide N-Atome des Se4N2-Moleküls chelatartig an das Titanatom gebunden sind.
    Zusätzliches Material: 1 Ill.
    Materialart: Digitale Medien
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