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  • 1
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    Springer
    Archives of microbiology 75 (1971), S. 312-326 
    ISSN: 1432-072X
    Quelle: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Thema: Biologie
    Beschreibung / Inhaltsverzeichnis: Zusammenfassung Aus dem neu isolierten Arthrobacter Stamm 23 wurde Threonin-Desaminase 11fach angereichert. Das Enzym ist in einem Isoleucin, Pyridoxalphosphat, EDTA und Dithioerythrit enthaltenden Phosphatpuffer von pH 7,9 bei 4° C mehrere Tage lang ohne Aktivitätsverlust haltbar. Für das Enzym wurden Substratsättigungskurven ermittelt, die in Abwesenheit von Isoleucin hyperbolisch, in Gegenwart des negativen Effectors Isoleucin sigmoid verliefen. Der Hill-Koeffizient von n=1,95 deutet auf zwei substratbindende Zentren am Enzymprotein hin. Isoleucin verändert nur den K m-Wert, beeinflußt aber nicht die maximale Reaktionsgeschwindigkeit des Enzyms. Das Enzym wird nicht nur durch Isoleucin, sondern auch durch Valin, Norvalin, Norleucin und im geringen Maße auch durch Leucin und α-Aminobuttersäure gehemmt. Kurzkettige Aminosäuren wie Alanin oder α-Aminoisobuttersäure hemmen das Enzym auch in hohen Konzentrationen nicht. Die Hemmkinetiken mit Isoleucin, Valin, Norvalin und Norleucin verlaufen sigmoid. Die Hill-Koeffizienten deuten auf zwei Bindungsstellen für alle Inhibitoren hin. Antagonistische Effekte zwischen Isoleucin und Valin oder den anderen negativen Effectoren waren nicht zu beobachten. Aus den kinetischen Daten war weiterhin zu schließen, daß die negativen Effectoren Valin, Norvalin und Norleucin an den gleichen Bindungsstellen des Enzymes angreifen wie Isoleucin. Das Enzym läßt sich durch Entzug seiner Effectoren inaktivieren. Eine Reaktivierung gelingt mit Isoleucin, Valin und Threonin und den möglichen Kombinationen dieser Aminosäuren.
    Notizen: Summary Threonine deaminase (l-threonine hydro-lyase [deaminating], EC 4.2.1.16) has been partially purified (11-fold) from Arthrobacter strain 23 isolated recently in this laboratory. The enzyme is rather labile in the crude extract and in the partially purified state; in phosphate buffer pH 7.9 containing isoleucine, pyridoxal phosphate, EDTA and dithiothreitol at 4°C it can be kept for several days without loss of activity. The enzyme yielded substrate saturation curves which were hyperbolic unless the inhibitor isoleucine was present. Sigmoid saturation curves were obtained in the presence of isoleucine. The Hill-coefficient of n=1.95 indicates the enzyme to contain two substrate binding sites. Isoleucine changes the K m-value, but does not influence the maximal reaction velocity of the enzyme. The enzyme is not only inhibited by isoleucine, but also by valine, norvaline, norleucine and at a minor degree by leucine and α-aminobutyric acid. It is not inhibited by alanine or α-amino-isobutyric acid, even at high concentrations. Substrate saturation curves determined in the presence of isoleucine, valine, norvaline, and norleucine are sigmoid. The Hill-coefficients indicate the enzyme to contain two binding sites for the inhibitor. Antagonistic effects between isoleucine and valine or the other negative effectors have not been observed. From the kinetic data it can furthermore be concluded that the same binding sites are used by the negative effectors isoleucine, valine, norvaline, and norleucine. When being deprived of its effectors the enzyme becomes inactivated. A reactivation occurs when the enzyme is incubated in the presence of isoleucine, valine, or threonine or combinations of these amino acids.
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  • 2
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    Springer
    Archives of microbiology 88 (1973), S. 299-318 
    ISSN: 1432-072X
    Quelle: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Thema: Biologie
    Notizen: Summary A new hydrogen bacterium has been isolated by enrichment culture on propane. It is a strictly aerobic, Gram-positive, non acid-fast bacterium, characterized by filamentous growth, and has been tentatively assigned to Nocardia opaca (strain 1 b). It grows heterotrophically, on many organic compounds (71 out of 138 tested substrates including organic acids and sugars), on hydrocarbons (C11−C18) as well as under autotrophic conditions (under an atmosphere of hydrogen, oxygen, and carbon dioxide=8:1:1) In the absence of a nitrogen source storage materials, mainly carbohydrates, are accumulated. Hydrogenase is an inducible enzyme. Under appropriate growth conditions the specific hydrogenase activity reaches high values: 2700 enzyme units/g cell protein. The formation of hydrogenase is repressed by fructose. With increasing oxygen concentrations during growth the specific hydrogenase activity decreases. In resting cell oxygen progressively inhibits the oxyhydrogen reaction. Cell-free extracts of autotrophically grown cells are able to reduce oxygen benzyl-and methyl viologen, dichlorphenolindophenol, methylene blue and nicotinamide adeninedinucleotide with hydrogen.
    Materialart: Digitale Medien
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  • 3
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    Springer
    Archives of microbiology 88 (1973), S. 319-330 
    ISSN: 1432-072X
    Quelle: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Thema: Biologie
    Notizen: Summary In Nocardia opaca strain 1b the key enzymes of the Entner-Doudoroff pathway, 6-phosphogluconate dehydrase and 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate aldolase, are inducible, while glucose-6-phosphate dehydrogenase and 6-phosphogluconate dehydrogenase are constitutively formed. In autotrophically grown cells the fructose diphosphate aldolase has six-fold specific activity compared to fructose- or gluconate-grown cells. Molecular hydrogen represses the adaptation to fructose, glucose, or gluconate and inhibits the utilization of glucose or fructose. Glucose-6-phosphate dehydrogenase has been purified 22fold. It utilizes either NADP of NAD as coenzyme; it requires magnesium ions for maximal activity. The dehydrogenation reaction is competitively inhibited by rather high concentrations (2–6 mM) of ATP, and in a similar fashion by phosphoenolpyruvate. Homotropic or heterotropic interactions between substrate molecules were not detected. The effect of ATP is relieved by equimolar concentrations of magnesium.
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  • 4
    ISSN: 1432-072X
    Schlagwort(e): Intracellular Concentrations ; Pool Size (PEP, ATP, ADP, AMP, NAD, NADH, G-6-P, 6-PG, F-6-P) ; Glucose 6-Phosphate Dehydrogenase ; Enzyme Regulation
    Quelle: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Thema: Biologie
    Notizen: Abstract The inhibition of fructose utilization by whole cells of Hydrogenomonas eutropha H 16, following the addition of hydrogen to the gas phase, has been explained as an inhibition of glucose 6-phosphate dehydrogenase (Blackkolb and Schlegel, 1968a, b). The intracellular concentrations of glucose 6-phosphate, 6-phosphogluconate, three inhibitors of the enzyme (NADH, ATP and phosphoenolpyruvate) and some related metabolites were measured in cells incubated in the presence and absence of hydrogen. Inhibition of glucose 6-phosphate dehydrogenase was confirmed by an increase in the glucose 6-phosphate pool and a decrease in the 6-phosphogluconate concentration. The regulatory control is apparently due to a threefold increase in the NADH concentration while the concentrations of the other two inhibitors fell slightly. When the measured intracellular concentrations of intermediates were used in the in vitro assay of glucose 6-phosphate dehydrogenase activity, an almost total inhibition of the dehydrogenase was observed, therefore further regulatory factors must be considered.
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  • 5
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    Springer
    Archives of microbiology 97 (1974), S. 359-362 
    ISSN: 1432-072X
    Schlagwort(e): Hydrogen-Bacteria ; Nitrogen Fixation ; Acetylene Reduction ; Coryneform Bacteria Strains 14g and 7C
    Quelle: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Thema: Biologie
    Notizen: Abstract The Gram-positive coryneform bacteria strains 14g and 7C were found to be able to grow with N2 as sole nitrogen source when incubated under microaerobic conditions. Nitrogenase activity in whole cells was assayed by acetylene reduction. High rates of ethylene production (50–120 nmole/hxmg cell protein) were observed in N2 or glutamate grown cell suspensions shaken in an atmosphere of 2.5% O2, 10% acetylene and 87.5% argon.
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  • 6
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    Springer
    Archives of microbiology 100 (1974), S. 207-217 
    ISSN: 1432-072X
    Schlagwort(e): Coryneform Hydrogen Bacteria ; Taxonomical Classification ; Corynebacterium autotrophicum
    Quelle: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Thema: Biologie
    Notizen: Abstract Recently isolated coryneform hydrogen bacteria were investigated under taxonomical aspects. Strains 7 C, RH 10, and 14 g are characterized by the snapping type of cell division, 68.5 to 69.7% GC content, dl-diaminopimelic acid in the cell wall, content of metachromatic granules, weak utilization of sugars and inhibitory effect of citrate. The strains are placed to the group 1—genus Corynebacterium—of the classification of coryneform bacteria of Yamada and Komagata (1972) and the name Corynebacterium autotrophicum sp.nov. is proposed. Strains 11 X and RH 12 are characterized by the bending type of cell division, a GC content of 70.2 and 70.5%, ll-diaminopimelic acid in the cell wall, absence of metachromatic granules, utilization of several sugars and no changes in cell morphology by citrate. The strains have to be placed to group 6 of coryneform bacteria.
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  • 7
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    Springer
    Archives of microbiology 71 (1970), S. 67-78 
    ISSN: 1432-072X
    Quelle: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Thema: Biologie
    Beschreibung / Inhaltsverzeichnis: Zusammenfassung Aus zellfreiem Extrakt von Hydrogenomonas H 16 wurde die lösliche Hydrogenase 45 fach bis zu einer spezifischen Aktivität von 36500 E/g Protein angereichert. Das Enzym katalysiert die Reduktion von NAD mit molekularem Wasserstoff. Ein Cofaktorbedürfnis konnte nicht festgestellt werden. Der Einfluß von NADH, ATP, Bicarbonat und Magnesium auf die hydrogenasekatalysierte NAD-Reduktion war unerheblich. Das angereicherte Enzym ist flavin- und pyridinnucleotidfrei und reagiert mit NAD, nicht mit O2, NADP, FMN, FAD oder Methylenblau. Die drei letztgenannten Wasserstoff-Acceptoren werden lediglich in Gegenwart katalytischer Mengen NAD reduziert. Die lag-Phase der Reduktion von NAD läßt sich durch Vorinkubation des Enzyms mit NADH oder Wasserstoff, nicht jedoch mit NAD eliminieren. Die Hemmung der Hydrogenasereaktion durch Sauerstoff ist gering. Reduzierende Agenzien wie Mercaptoäthanol oder Sulfid setzten die Reaktionsrate herab. Die Michaeliskonstante der löslichen Hydrogenase für molekularen Wasserstoff beträgt K m H2 =1,9·10−4 M. Die NAD-Konzentration, bei der halbmaximale Aktivität erreicht wird, beträgt [NAD]0,5 (V)=1,3·10−4 M. Das pH-Optimum wird in 0,05 M Kaliumphosphat-Puffer bei pH 8,5 und in 0,05 M Tris-HCl-Puffer bei pH 7,9 erreicht. Unter den angegebenen Bedingungen lag das Temperatur-Optimum bei 36°C. Die Aktivierungsenergie der löslichen Hydrogenase wurde als 10,4 kcal/mol ermittelt.
    Notizen: Summary A soluble hydrogenase from cell-free extracts of Hydrogenomonas H 16 has been purified 45-fold up to a specific activity of 36,500 units per g protein. The enzyme catalyzes the reduction of NAD with molecular hydrogen. It does not require cofactors. The NAD-reduction catalyzed by this enzyme is influenced to only a small extent by the presence of NADH, ATP, bicarbonate or magnesium ions. The enzyme is free from flavins and pyridine nucleotides, reacts only with NAD and not with oxygen, NADP, FMN, FAD or methylene blue. FMN, FAD and methylene blue are reduced only in the presence of catalytic amounts of NAD. The lag-phase of the reduction of NAD can be eliminated by preincubating the enzyme in the presence of NADH or molecular hydrogen; NAD is ineffective. The inhibition of the hydrogenase reaction by oxygen is negligible. Reducing agents such as mercaptoethanol or sulfide decreased the reaction rate. The Michaelis constant of the soluble hydrogenase for molecular hydrogen is K m H2 =1.9·10−4 M. Half maximal activity is attained at a NAD-concentration of [NAD]0.5 (V)=1.3·10−4 M. The pH-optimum is 8.5 in 0.05 M potassium phosphate buffer and 7.9 in 0.05 M Tris-HCl-buffer; reaction rates were maximal at 36°C under the conditions employed. The activation energy was calculated to be 10.4 kcal/mol.
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  • 8
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    Springer
    Archives of microbiology 79 (1971), S. 204-219 
    ISSN: 1432-072X
    Quelle: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Thema: Biologie
    Beschreibung / Inhaltsverzeichnis: Zusammenfassung 1. Rohextrakte und teilweise gereinigte Enzympräparate aus Hydrogenomonas eutropha Stamm H 16 wurden auf die Enzyme der Carboxylierung von Pyruvat und Phosphoenolpyruvat geprüft. Zur Bestimmung der Enzymaktivitäten wurden radiometrische Methoden unter Verwendung von 14C-Bicarbonat angewandt, da optische Tests auf Grund hoher Aktivitäten von NADH-Oxydase zu unbefriedigenden Ergebnissen führten. 2. Die Geschwindigkeiten der CO2-Fixierung in den verschiedenen experimentellen Ansätzen sind vom Wachstumssubstrat der Zellen (Fructose, Lactat, Succinat und Wasserstoff + Kohlendioxyd) abhängig. 3. Die Aktivitäten der Phosphoenolpyruvat-Carboxykinase und Phosphoenolpyruvat-Carboxylase sind hoch. Die Aktivität des letztgenannten Enzyms ließ sich durch Zusatz von Acetyl-Coenzym A auf das 4–5 fache erhöhen. 4. Das Vorhandensein einer biotin-abhängigen Pyruvat-Carboxylase ließ sich ausschließen; unter den angewandten experimentellen Bedingungen wurde das Enzym in Extrakten aus Hefe ohne Schwierigkeit nachgewiesen. 5. Die Ergebnisse werden im Hinblick auf die bisher an autotrophen Mikroorgnismen durchgeführten Untersuchungen dieses Stoffwechselzweigs diskutiert.
    Notizen: Summary 1. Crude extracts and partially purified enzyme preparations obtained from Hydrogenomonas eutropha strain H 16 have been tested for enzymes carboxylating pyruvate and phosphoenolpyruvate. Radiometric methods employing 14C-bicarbonate have been used for the determination of enzyme activities; due to the presence of high activities of NADH oxidase coupled optical tests were unsatisfactory. 2. The rates of carbon dioxide fixation are dependent on the growth substrate of the cells (fructose, lactate, succinate, and hydrogen + carbon dioxide). 3. The activities of phosphoenolpyruvate carboxykinase and phosphoenolpyruvate carboxylase are high. By acetyl coenzyme A the latter enzyme was stimulated by a factor of four or five. 4. The presence of a biotin dependent pyruvate carboxylase could be excluded, while under the same experimental conditions this enzyme could be determined in yeast. 5. The results are discussed with respect to similar investigations in other autotrophic microorganisms.
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  • 9
    Digitale Medien
    Digitale Medien
    Springer
    Archives of microbiology 79 (1971), S. 220-230 
    ISSN: 1432-072X
    Quelle: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Thema: Biologie
    Beschreibung / Inhaltsverzeichnis: Zusammenfassung Zellfreie Extrakte aus Hydrogenomonas eutropha Stamm H 16 katalysieren die Biosynthese von Phosphoenolpyruvat aus Pyruvat und Adenosintriphosphat. Unter identischen Bedingungen erfolgte diese Synthese auch durch Extrakte aus Escherichia coli. Das Reaktionsprodukt Phosphoenolpyruvat wurde durch Papierchromatographie, durch Anwendung von radioaktivem Pyruvat und durch einen gekoppelten enzymatischen Test unter Einsatz eines gereinigten Präparates von 3-Desoxy-d-arabino-heptulosonsäure-7-phosphat Synthase, AMP wurde als zweites Produkt der PEP-Synthasereaktion nachgewiesen. Die Versuchsergebnisse lassen darauf schließen, daß der Stamm H 16 über ein Enzym verfügt, welches Pyruvat direkt phosphoryliert.
    Notizen: Summary Crude extracts from Hydrogenomonas eutropha strain H 16 catalyze the biosynthesis of phosphoenolpyruvate from pyruvate and adenosine triphosphate. Under identical conditions extracts from Escherichia coli synthesized phosphoenol-pyruvate from pyruvate also. The reaction product phosphoenolpyruvate has been identified by paper chromatography, by employing radioactive pyruvate and by a coupled enzyme assay, using a purified preparation of 3-deoxy-d-arabino-heptulonic acid-7-phosphate synthase. AMP has been found as the second product of the PEP-synthase reaction. From these results it is concluded that strain H 16 contains an enzyme phosphorylating pyruvate directly.
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  • 10
    Digitale Medien
    Digitale Medien
    Springer
    Archives of microbiology 83 (1972), S. 17-31 
    ISSN: 1432-072X
    Quelle: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Thema: Biologie
    Beschreibung / Inhaltsverzeichnis: Zusammenfassung Der Tyrosinbedarf von tyrosinbedürftigen Mutanten von Hydrogenomonas eutropha (Alcaligenes eutrophus) Stamm H 16 (ATCC 17699) läßt sich außer durch l-Tyrosin auch durch l-Phenylalanin befriedigen. Suspensionen intakter Wildtypzellen setzen Phenylalanin zu Tyrosin um und scheiden es in die Nährlösung aus. Da Tyrosin mit etwa der gleichen Rate umgesetzt wird, kommt es zu einer nur vorübergehenden Akkumulation. Durch zellfreie Extrakte wird Phenylalanin in Gegenwart von NAD(P)H2 und Sauerstoff unter Bildung von Tyrosin hydroxyliert. Die Anfangsrate beträgt 20 E/g Protein. Tyrosin wird mit etwa der gleichen Rate abgebaut. Im Rohextrakt kommt es nach einer anfänglichen Akkumulation von Tyrosin (2–3 mM) zur Einstellung einer steady state-Konzentration, die unter 1 mM liegt. Die Phenylalanin-Hydroxylase benötigt außer den genannten Komponenten noch wenigstens einen dialysierbaren, durch Chromatographie an Sephadex-G 25 abtrennbaren Cofaktor. Phenylalanin-Hydroxylase wird in Stamm H 16 durch l-Phenylalanin induziert, nicht durch l-Tyrosin, Phenylpyruvat, Hydroxyphenylpyruvat oder l-Tryptophan. Phenylalanin wirkt nur induzierend, wenn es der Nährlösung in Substratkonzentrationen (0,2%) beigefügt wird, nicht hingegen in Supplinkonzentrationen (20 μg/ml). Phenylalanin-Hydroxylase ließ sich nur in den Stämmen nachweisen, die auf Phenylalanin als C- und Energiequelle wachsen (Hydrogenomonas eutropha H 16, Pseudomonas facilis, Stamm 12 X), nicht in einigen anderen geprüften Stämmen.
    Notizen: Summary The tyrosine requirement of tyrosine-dependent mutants of Hydrogenomonas eutropha (Alcaligenes eutrophus) strain H 16 (ATCC 17699) can be satisfied by l-tyrosine as well as by l-phenylalanine. Tyrosine is formed from l-phenylalanine by suspensions of intact wild type cells and is excreted into the medium. It is only transiently accumulated in the medium since it is further metabolized by the cells at a rate comparable to that of phenylalanine. Phenylalanine is converted to tyrosine by cell-free extracts in the presence of NAD(P)H2 and oxygen; the initial rate of tyrosine formation is 20 units per g protein. Tyrosine is degraded at an approximately equal rate. After the addition of l-phenylalanine to the crude extract tyrosine is formed and accumulated up to a 2–3 mM concentration and reaches a steady state concentration of less than 1 mM tyrosine. In addition to the components mentioned, the phenylalanine hydroxylase reaction requires at least one dialysable cofactor which has been separated by chromatography on sephadex-G 25. In strain H 16 phenylalanine hydroxylase is induced by l-phenylalanine; it is not induced by l-tyrosine, phenylpyruvate, hydroxyphenylpyruvate or l-tryptophan. Induction occurs only when phenylalanine is added to the growth medium in substrate concentrations (e.g. 0.2%); growth factor concentrations (20 μg/ml) are not effective. Phenylalanine hydroxylase has been found only in those strains which are able to utilize phenylalanine as a carbon and energy source for growth: H. eutropha H 16, Pseudomonas facilis, strain 12X.
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