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  • 11
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    Springer
    Archives of microbiology 61 (1968), S. 292-301 
    ISSN: 1432-072X
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Biology
    Description / Table of Contents: Zusammenfassung Das Murein (Peptidoglycan) eines aus Faeces isolierten Streptococcus, der in den wichtigsten Merkmalen mit Peptostreptococcus evolutus (Prevot) Smith übereinstimmt, weist folgende Molverhältnisse auf (aufgerundete bzw. abgerundete Zahlen): Mur:GlcNH2:Ala:Glu:Lys:Gly=1:1:3:1:1:1. Das Verhältnis l-Alanin:d-Alanin=2,15:1. Die Glutaminsäure liegt in der d-Konfiguration und als Amid vor. Durch die Partialhydrolyse der Zellwände und die anschließende Isolierung und Identifizierung der Peptide konnte die Aminosäuresequenz des Mureins geklärt werden. Das Tetrapeptid stimmt mit der üblichen Sequenz l-Ala-d-Glu-NH2-l-Lys-d-Ala der meisten übrigen Bakterien überein. Die Quervernetzung des Mureins wird durch das Peptid Glycyl-l-Alanin hergestellt, wobei l-Alanin an die ɛ-Aminogruppe des Lysins gebunden ist. Die Dinitrophenylierung der Zellwand ergab, daß 35% des Glycins und 6% des Lysins eine freie Aminogruppe aufweisen. Die Quervernetzung ist demnach nur zu höchstens 60% durchgeführt.
    Notes: Summary Peptostreptococcus evolutus was isolated from feces. Its murein containes muramic acid, glucosamine, alanine, d-glutamic acid, lysine and glycine at a molar ratio of about 1:1:3:1:1:1. The ratio of l-alanine: d-alanine is 2,15:1. Glutamic acid is present as an amide. By acid partial hydrolysis of the cell walls and subsequent isolation and identification of the peptides the amino acid sequence of the murein was elucidated. The tetrapeptide is identical with that of most bacteria (l-Ala-d-Glu-NH2-l-Lys-d-Ala). The crosslinking of the murein is performed by the peptide glycyl-l-alanine. l-alanine is attached to the ɛ-amino group of lysine while the amino group of glycine is bound to the carboxyl group of the c-terminal d-alanine of an adjacent tetrapeptide. About 35% glycine and 6% lysine of the murein are dinitrophenylisable indicating that maximally 60% of the possible cross-linkages are realized.
    Type of Medium: Electronic Resource
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  • 12
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    Springer
    Archives of microbiology 62 (1968), S. 198-208 
    ISSN: 1432-072X
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Biology
    Description / Table of Contents: Zusammenfassung Das Murein eines aus Milch isolierten Stammes von Staphylococcus epidermidis weist folgende Molverhältnisse auf (auf- bzw. abgerundete Zahlen): Mur:GlcNH2:Ala:Glu:Lys:Gly=1:1:3:1:1:4. Das Verhältnis D-Ala:L-Ala ist 1:2,03. Die Glutaminsäure liegt in der D-Konfiguration und als Amid vor. Durch die Isolierung und Identifizierung der Peptide des Partialhydrolysats des Mureins konnte die Aminosäuresequenz erschlossen werden. Die Sequenz des an die Muraminsäure gebundenen Tetrapeptides (L-Ala-D-GluNH2-L-Lys-D-Ala) stimmt mit dem der meisten anderen Bakterien überein. Die Quervernetzung wird durch das Peptid (Gly)4–5-L-Ala hergestellt, das mit dem N-terminalen Glycin an die Carboxylgruppe des D-Alanins und mit dem C-terminalen L-Alanin an die ε-Aminogruppe des Lysins zweier benachbarter Tetrapeptide gebunden ist. Die Dinitrophenylierung des Mureins ergab, daß 2% des Lysins (ε-Aminogruppe), 3% des gesamten Alanins und 7% des gesamten Glycins N-terminal vorliegen. Demnach ist die Quervernetzung nur zu rund 60% realisiert. Neben unvernetzten mehr oder weinger vollständigen Interpeptidbrücken kommen auch unvollständige Peptide vor, bei denen nur L-Alanin an die ε-Aminogruppe des Lysins gebunden ist. In mindestens 2% der Fälle fehlt die Interpeptidkette völlig.
    Notes: Summary A strain of Staphylococcus epidermidis was isolated from raw milk. Its murein contained muramic acid, glucosamine, alanine, D-glutamic acid, L-lysine and glucine at a molar ratio of about 1:1:3:1:1:4. The ratio D-Ala: L-Ala is 1:2.03. D-glutamic acid is present as an amide. By partial acid hydrolysis of the cell wall and subsequent isolation and identification of the peptides the amino acid sequence of the murein was elucidated. The tetrapeptide, bound to muramic acid is identical with that of most bacteria: L-Ala-D-GluNH2-L-Lys-D-Ala. The crosslinking of the murein is performed by the peptide (Gly)4–5-L-Ala. L-Ala is attached to the ε-aminogroup of lysine, while the N-terminal glycine is bound to the C-terminal D-alanine of an adjacent tetrapeptide. About 2% of lysine, 3% of alanine and 7% of glycine of the murein are dinitrophenylizable, indicating that about 2% of the tetrapeptides are not substituted by an interpeptide chain, and that 40% of the interpeptide chains are more or less incomplete (10% consist of L-alanine only) and are not bound to a C-terminal D-alanine.
    Type of Medium: Electronic Resource
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  • 13
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    Springer
    Archives of microbiology 71 (1970), S. 271-282 
    ISSN: 1432-072X
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Biology
    Description / Table of Contents: Zusammenfassung Die quantitative Aminosäurezusammensetzung des Mureins von M. flavum, M. thermosphactum, M. lacticum und M. liquefaciens wurder untersucht. Das Murein von M. flavum und M. thermosphactum weist folgende Molverhältnisse auf (auf- bzw. abgerundete Zahlen): DAP:Glu:Ala=1:1:1,5-1,7. Außerdem konnten 1,8 Mol Ammoniak pro Mol Glutaminsäure gefunden werden, was für ein Vorliegen von Glu und DAP als Amid spricht. Für das Murein von M. lacticum und M. liquifaciens ergeben sich folgende auf- bzw. abgerundete Molverhältnisse: M. lacticum: Hyg + Glu:Gly:L-Lys:D-Ala=1:2:2:1; M. liquefaciens: Hyg + Glu:Gly:hsr:D-Orn:D-Ala=1:2:1:1:1. Die Aminosäuresequenz des Mureins von M. liquefaciens konnte durch die Analyse der in den sauren Partialhydrolysaten der Zellwände auftretenden Peptide bestimmt werden. Das Murein von M. liquefaciens weist eine ähnliche Aminosäuresequenz wie das Murein von M. lacticum auf. Das an die Muraminsäure gebundene Tetrapeptid zeigt die Sequenz: Gly-Hyg(Glu)-Hsr-D-Ala. Die an der Quervernetzung beteiligte Interpeptidbrücke Nδ-Gly-D-Orn ist mit seinem Glycinende an die α-Carboxylgruppe der Hyg (Glu) und mit der α-Aminogruppe des D-Orn an das D-Ala einer benachbarten Peptiduntereinheit gebunden. Die Primärstruktur des Mureins von M. flavum und M. thermosphactum dagegen gleicht der des Mureins von Corynebacterium diphtheriae, wie aufgrund der quantitativen Aminosäurezusammensetzung und der „Fingerprints” von Partialhydrolysaten gefolgert werden konnte. M. flavum und M. thermosphactum unterscheiden sich aber nicht nur in ihrem Mureinaufbau, sondern auch in ihrer Morphologie und bestimmten physiologischen Merkmalen von M. lacticum und M. liquefaciens. Sie gleichen mehr den menschen- und tierpathogenen Corynebakterien und sollen daher aus der Gattung Microbacterium eliminiert werden. M. lacticum und M. liquefaciens zeigen dagegen eine weitgehende Ähnlichkeit mit bestimmten pflanzenpathogenen Corynebakterien.
    Notes: Summary The quantitative amino acid composition of the murein of M. flavum, M. thermosphactum, M. lacticum and M. liquefaciens was determined. The murein of M. flavum and M. thermosphactum contains DAP, Blu and Ala at a molar ratio of about 1:1:1,5-1,7. In addition, 1,8 moles of ammonia were found per mole of glutamic acid, indicating, that both DAP and Glu are present as amides. The murein of M. lacticum and M. liquefaciens showed the following molar ratios. M. lacticum: Hyg1+Glu:Gly:L-Lys:D-Ala=1:2:2:1; M. liquefaciens: Hyg+Glu:Gly:Hsr: D-Orn:D-Ala=1:2:1:1:1. The amino acid sequence of the murein of M. liquefaciens was determined by analysing the various peptides from acid partial hydrolysates of the cell walls. The murein of M. liquefaciens resembles the murein of M. lacticum. The tetrapeptide bound to the muramic acid has the sequence: Gly-Hyg(Glu)-Hsr-D-Ala. The cross-linkage is performed in the same way as in M. lacticum. The interpeptide bridge Nδ-Gly-D-Orn is bound by its glycine end to the α-carboxyl group of Hyg(Glu) and by the α-amino group of D-Orn to D-Ala of an adjacent peptide subunit. The primary structure of the murein of M. flavum and M. thermosphactum is similar to that of the murein of Corynebacterium diphtheriae as has been shown by the quantitative amino acid composition and the fingerprints of the partial hydrolysates of the cell walls. M. flavum and M. thermosphactum can be distinguished from M. lacticum and M. liquefaciens not only by murein type but also in morphology and certain physiological characteristics. They are closely related to the human and animal pathogenic corynebacteria and should be removed from the genus Microbacterium. M. lacticum and M. liquefaciens, on the other hand, differ significantly from human and animal pathogenic corynebacteria and show greatest similarity to certain plant pathogenic corynebacteria.
    Type of Medium: Electronic Resource
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 14
    ISSN: 1432-072X
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Biology
    Description / Table of Contents: Zusammenfassung Beim Wachstum von S. epidermidis, Stamm 24, in Hefe-Dextrose-Bouillon weist das Murein folgende Molverhältnisse auf (auf- bzw. abgerundete Zahlen): Mur-GlcNH2:Ala:Glu:Lys:Gly:Ser=1:1:2,4:1:1:4,2:0,6. Die Glutaminsäure ist amidiert. Durch Isolierung und Identifizierung der Peptide des Partialhydrolysates des Mureins wurde die Aminosäuresequenz bestimmt. Die an die Muraminsäure gebundene Peptiduntereinheit (l-Ala-d-GluNH2 γ-l-Lys-d-Ala) stimmt mit der von S. aureus, Copenhagen bzw. S. epidermidis, Stamm 66, überein. Bei knapp einem Drittel der Peptiduntereinheiten ist das C-terminale d-Alanin der Mureinvorstufe nicht abgespalten, so daß diese noch als Pentapeptide vorliegen. Dies konnte aus dem Verhältnis l-Ala/d-Ala (1:1,3), dem Ergebnis der Hydrazinolyse und der Isolierung der Muropeptide nach Spaltung der Zellwände mit Lysozym geschlossen werden. Bei etwa der Hälfte aller aus 5 Glycinresten aufgebauten Interpeptidketten ist ein Glycinrest durch l-Serin ersetzt. Die genaue Position des Serins konnte nicht bestimmt werden. Serin ist sicher nicht direkt an die ɛ-Aminogruppe des Lysins gebunden. In selteneren Fällen kann Lysin mit l-Alanin substituiert sein, das N-terminal vorliegt und nicht der Quervernetzung dient. Die Dinitrophenylierung des Mureins ergab, daß in etwa 3,5% der Fälle die Interpeptidketten fehlen und rund ein Drittel der Interpeptidketten nicht quervernetzt ist. Bei Wachstum in einem halbsynthetischen, glycinarmen Medium (Minimal, medium) nimmt der Glycinanteil des Mureins um rund 40% ab, während l-Alanin zunimmt. Es konnte gezeigt werden, daß rund 15% des Mureins ein an die ɛ-Amino-gruppe des Lysins gebundenes l-Alanin enthalten, das aber im Unterschied zu S. epidermidis, Stamm 66, nicht mit Glycin substituiert ist, sondern N-terminal bleibt und nicht zur Quervernetzung benützt werden kann. Weiterhin liegen hier rund 35% des Lysins unsubstituiert vor, und nur etwa 50% der Peptiduntereinheiten weisen eine Pentaglycyl-Interpeptidkette auf. Die Quervernetzung des Mureins ist bei den in Minimalmedium gewachsenen Zellen nur zu rund 30% durchgeführt. Bei Zusatz von Glycin zum Minimal-Nährboden wird der Glycingehalt im Murein erhöht, während der “extra” Alaninanteil praktisch verschwindet. Serinzusatz erhöht nicht nur den Serin-, sondern auch den Glycinanteil. Bei Alaninzusatz dagegen wird der Alaningehalt im Murein etwas erhöht und der Glycingehalt weiter erniedrigt. Die Ergebnisse dieser Untersuchungen wurden mit entsprechenden, vorläufigen Versuchen bei S. epidermidis, Stamm 66 und S. aureus, Stamm Copenhagen, verglichen. Es zeigt sich, daß trotz starker modifikativer Veränderungen der Mureinzusammensetzung eindeutige genetische Unterschiede zwischen diesen drei Stämmen vorliegen.
    Notes: Summary The murein (peptidoglycan) of S. epidermidis strain 24 contains Mur GlcNH2, Ala, Glu, Lys, Gly, Ser at a molar ratio of about 1:1:2.4:1:1:4.2:0.6 when grown in a yeast extract dextrose medium. Glutamic acid occurs as an amide. The amino acid sequence was determined by analysing the oligopeptides from partial acid hydrolysate. The tetrapeptide bound to the muramic acid (l-Ala-d-Glu-NH2-l-Lys-d-Ala) is identical with those found in S. aureus and S. epidermidis strain 66. About 1/3 of the muropeptides is still present as pentapeptides, since the second d-alanine of the muramyl pentapeptide precursor is not split off. This fact is indicated by the ratio of l-Ala/d-Ala of 1:1.3, the isolation of muropentapeptides from the lysozyme lysates and by the result of the hydrazinolysis. About 50% of the pentaglycine interpeptide chains contain one mole of l-serine. The exact position of l-serine could not be determined. However, it could be shown, that serine is never bound to the ɛ-amino group of lysine. In very rare cases, the ɛ-amino group of lysine is substituted by l-alanine which remains N-terminal and can not be used for crosslinkages. As shown by dinitrophenylation, about 3.5% of the ɛ-amino groups of lysine is free and about 50% of the interpeptide chains are not cross-linked. If the organism is grown in a glycine deficient minimal medium, the glycine content of the murein drops by 40%, while l-alanine increases. Here, about 15% of the ɛ-amino groups of lysine is substituted by l-alanine, which again is not used for cross-linkages. Another 35% of the ɛ-amino groups of lysine remain free. From the existing interpeptide chains 30% are not cross-linked. The addition of glycine to the minimal medium causes an increase of the glycine content in the murein, however, the extra alanine protion nearly disappears. The addition of serine leads to an increase of not only the serine portion but also the glycine portion in the murein. However, when alanine is added the alanine portion of murein is slightly increased and the glycine portion further decreased. The results of these experiments were compared to corresponding preliminary experiments with S. epidermidis (strain 66) and S. aureus (strain Copenhagen). In spite of modificative changes in the murein composition, clear genetical differences between the 3 strains were obvious.
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  • 15
    ISSN: 1432-1440
    Keywords: Shock ; endotoxin ; mucopeptide ; limulus-test ; Schock ; Endotoxin ; Mucopeptid ; Limulus-Test
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Medicine
    Description / Table of Contents: Zusammenfassung Nicht nur die Endotoxine gramnegativer Bakterien, sondern auch die Mucopeptide verschiedener grampositiver Erreger können eine Gelierung von Amöbocytenlysaten ausLimulus polyphemus (LPL) hervorrufen. Offenbar abhängig von dem Grad der Solubilisierung ist die Wirksamkeit der Mucopeptide zwischen 1000 und 100000mal geringer als die von Endotoxin. Im Gegensatz zu Endotoxin hat die Behandlung von Mucopeptid mit Lysozym eine Abnahme bzw. einen vollständigen Verlust seiner Aktivität im LPL-Test zur Folge. Ein so behandeltes Mucopeptid ist im einfachen Capillarpräcipitationstest unter Verwendung von Antiseren gegen Mucopeptid ebenfalls nicht mehr präcipitierbar. Die Möglichkeit, die LPL-Aktivität von Mucopeptid durch Vorbehandlung mit Lysozym aufzuheben, erlaubt eine Abgrenzung gegenüber der Endotoxin-bedingten LPL-Gelierung. Bei im LPL-Test positiven Blutproben von Patienten mit Verdacht auf Endotoxämie könnte also eine Mucopeptid-induzierte LPL-Reaktion durch Vorbehandlung mit Lysozym ausgeschlossen werden.
    Notes: Summary Gelation of amebocyte lysate fromLimulus polyphemus (LPL) is induced not only by endotoxins of gramnegative bacteria but also by mucopeptides of various grampositive organisms. Solubilization considerably increases mucopeptide LPL-activity. Total activity of mucopeptide, however, is about 1000-100 000 times smaller than that of endotoxin. In contrast to endotoxin, treatment of mucopeptide with lysozyme causes decrease or complete loss of LPL-activity. Also mucopeptide thus handled does not react any more in the capillary precipitin test. The possibility to destroy mucopeptide LPL-activity by pretreatment with lysozyme permits differentiation from LPL-gelation by endotoxin. In blood specimens of patients with suspected endotoxemia and positive LPL-test mucopeptide induced LPL-reaction therefore can be excluded by pretreatment with lysozyme.
    Type of Medium: Electronic Resource
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  • 16
    ISSN: 1432-072X
    Keywords: Arylamine N-acetyltransferase ; Metabolism of aromatic amines ; Soil microorganisms ; Bacillus cereus
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Biology
    Notes: Abstract The raw extracts of a series of microorganisms were screened for the presence of acetyl-coenzyme A: arylamine N-acetyltransferase (AAAT) using a radioactive assay with 3H-acetyl-coenzyme A and aniline as substrates. Enzyme activities were primarily detected in the soluble fractions of Bacillus and Nocardia species, and in some further soil organisms. Only strains of Bacillus cereus were able to acetylate 4-nitroaniline and 3,5-dimethyl-4-nitroaniline. The fermentation conditions for the production of the enzyme were optimized. The AAAT from one strain of Bacillus cereus was purified 24-fold and characterized.
    Type of Medium: Electronic Resource
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  • 17
    ISSN: 1432-072X
    Keywords: Coagulase-positive staphylococci ; Cell wall composition ; Lactic acid configuration ; FDP-activatedl-LDH ; Esterase pattern ; Staphylococcus aureus
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Biology
    Notes: Abstract The cell wall composition, the configuration of lactic acid produced from glucose under anaerobic conditions, the occurrence of fructose-1,6-diphosphate (FDP) activatedl-lactate dehydrogenase (l-LDH), and the esterase pattern were determined from more than 80 strains of coagulase-positive staphylococci isolated from man and animal. Strains isolated from man, swine, bovines and hares form a rather homogencous group. They exhibit a similar cell wall composition, produce predominantlyd,l-lactate and have a characteristic and simple esterase pattern. Coagulasepositive staphylococci isolated from dogs, horses, minks and pigeons are quite distinct from typicalStaphylococcus aureus strains. They exhibit a different cell wall composition, produce onlyl-lactate, possess anl-LDH which is specifically activated by FDP, and have a quite complex esterase pattern.
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  • 18
    Electronic Resource
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    Springer
    Archives of microbiology 117 (1978), S. 183-188 
    ISSN: 1432-072X
    Keywords: Coagulase-positive staphylococci ; DNA-DNA reassociation ; Staphylococcus aureus
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Biology
    Notes: Abstract DNA-DNA reassociation studies were performed with coagulase-positive staphylococci belonging to the biotypes A, B, C, D, E and F. These studies present genetic evidence for the existence of at least two distinct species within this group of organisms. The common Staphylococcus aureus strains were represented by organisms from biotypes A to D, and their DNA revealed over 80% nucleotide sequence homology under restrictive conditions. Less than 15% DNA homology was detected between strains from biotypes A to D (S. aureus) and those from biotypes E and F. The DNA of organisms from either the biotypes E or F displayed over 70% homology. Together, both biotypes are considered to represent the species S. intermedius. However, DNA homology values dropped to 50–65% between strains from different biotypes. This may justify the separation of S. intermedius biotypes E and F on a subspecies level.
    Type of Medium: Electronic Resource
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 19
    ISSN: 1432-072X
    Keywords: Rapid methods ; Cell wall teichoic acids ; Staphylococci
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Biology
    Notes: Abstract Investigations of cell wall teichoic acid structures of various staphylococci were carried out by a rapid method based on the gas-liquid chromatographic separation of products obtained after treatment of phenol-extracted cells with 70% hydrofluoric acid. In most of the strains teichoic acids of the poly(glycerolphosphate) and/or poly(ribitolphosphate) type were found. Teichoic acids of the poly(glycerolphosphate-N-acetylglucosaminephosphate) type and polymers consisting of N-acetylglucosaminephosphate were present in few strains. The results obtained by the rapid chemical screening method were compared with data obtained by serological analysis of teichoic acid structures using specific antisera and the lectin wheat germ agglutinin. Teichoic acid components occurring in low concentrations could only be detected with the chemical and not with the serological method. A number of strains of species of the genus Staphylococcus have been studied using these rapid methods. With a few exceptions, the teichoic acid structure proved to be a constant marker within a given species.
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    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 20
    ISSN: 1432-072X
    Keywords: Elongation factor Tu ; Tuf gene ; Eubacteria ; Phylogenetic relationship ; Functional and structural elements of EF-Tu
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Biology
    Notes: Abstract The nucleotide sequences of cloned genes coding for the elongation factor Tu of seven eubacteria have been determined. These genes were fiom Anacystis nidulans, Bacillus subtilis, Bacteroides fragilis, “Deinonema” spec., Pseudomonas cepacia, Shewanella putrefaciens and Streptococcus oralis. The primary structures of the genes were compared to the available sequences of prokaryotic elongation factors Tu and eukaryotic elongation factors 1 alpha. A conservation profile was determined for homologous amino acid residues. Sites of known or putative functions are usually located at highly conserved positions or within highly conserved sequence stretches. The aligned 24 amino acid sequences were used as basis for a phylogenetic analysis. The phylogenetic tree corroborates the kingdom as well as phylum concept deduced from 16S rRNA data.
    Type of Medium: Electronic Resource
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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