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  • 2005-2009  (8)
  • 1955-1959  (11)
  • 1890-1899
  • transformation  (11)
  • ddc:080  (8)
  • 1
    facet.materialart.
    Unknown
    Publication Date: 2019-10-24
    Keywords: ddc:080
    Language: German
    Type: annualzib , doc-type:report
    Format: application/pdf
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 2
    facet.materialart.
    Unknown
    Publication Date: 2019-10-24
    Keywords: ddc:080
    Language: German
    Type: annualzib , doc-type:report
    Format: application/pdf
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 3
    Publication Date: 2016-06-09
    Description: Im Rahmen dieser Arbeit wurde ein individuell anpassungsfähiges Modell entwickelt und implementiert, das die Perfusion in menschlichen soliden Tumoren beschreibt und für verschiedene Zeitpunkte w¨ahrend regionaler Hyperthermie ein lokal abhängiges Temperaturprofil berechnet. Da vor jeder Simulation alle wichtigen Parameter anhand von Ultraschall-, MRT- oder Angiogrammbildern individuell bestimmt werden können, wird eine patientenspezifische Aussage ¨uber das intratumorale Antwortverhalten bereits vor der eigentlichen Behandlung möglich. In Abh¨angigkeit von der Qualität der zur Verfügung stehenden anatomischen Daten über das zu simulierende Gebiet kann das Modell beliebig verfeinert oder bei Mangel an detaillierten Informationen auch mit Minimaldaten und reduzierter räumlicher Genauigkeit benutzt werden. Die für eine Simulation benötigten 2- oder 3- dimensionalen Geometrien können leicht mit der am ZIB entwickelten Software Amira erstellt und zur Berechnung in KARDOS, einem ebenfalls am ZIB implementierten Löser für nichtlineare partielle Differentialgleichungen, eingelesen werden. Mit Hilfe dieses Modells wird eine einfache, aber realistische und aussagekräftige Simulation für die Therapieplanung einer klinischen Hyperthermieanwendung ermöglicht, die innerhalb kurzer Zeit vorbereitet und durchgeführt werden kann.
    Keywords: ddc:080
    Language: German
    Type: masterthesis , doc-type:masterThesis
    Format: application/pdf
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 4
    Publication Date: 2016-06-30
    Description: In dieser Arbeit werden effiziente Co-Reservierungs-Algorithmen vorgestellt, mit denen Rechenressourcen mehrerer Cluster im Grid reserviert werden können. Es werden fünf Algorithmen vorgestellt, die flexible Co-Reservierungsanfragen ermöglichen. In einer Co-Reservierungsanfrage müssen die angeforderten CPUs der Teilreservierungen exakt festgelegt werden. Die Cluster und die Startzeiten, bei denen die Teilreservierungen durchgeführt werden, ermittelt ein Co-Reservierungs-Algorithmus erst bei der Anfragebearbeitung. Die Benutzer können die Startzeit in der Anfrage eingrenzen, in dem sie eine früheste Startzeit und eine Deadline angeben. In den bisher entwickelten Reservierungsverfahren können Benutzer nur starre Co-Reservierungsanfragen stellen, in denen sie für alle Attribute der Teilreservierungen exakte Werte angeben müssen. Eine flexible Co-Reservierungsanfrage erlaubt einem Grid-Reservierungsdienst optimierte Reservierungsvarianten durchzuführen, da er aus vielen Reservierungsvarianten auswählen kann. Die Anwendungen von lokalen Benutzern können durch die Grid-Reservierungen verzögert werden. Bei der Auswahl der Reservierungsvarianten kann ein Grid-Reservierungsdienst dies berücksichtigen und den negativen Einfluß der Grid-Reservierungen verringern. Bei zwei Co-Reservierungs-Algorithmen werden auch zusätzliche Sortiervorgaben des Klienten bei der Auswahl der Reservierungsvarianten beachtet. Die Algorithmen wurden durch Simulationen mit dem Workload eines realen großen Supercomputers ausgewertet. Die Untersuchungen zeigen, daß sowohl die lokalen als auch die Grid-Benutzer von den flexiblen Anfragen profitieren können. Den lokalen Benutzern wurden die Ressourcen weniger oft durch zu früh gestellte Reservierungsanfragen entzogen. Die Grid- Benutzer können ihrerseits komfortabel eine optimierte Reservierungsvariante durchführen lassen.
    Keywords: ddc:080
    Language: German
    Type: masterthesis , doc-type:masterThesis
    Format: application/pdf
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 5
    Publication Date: 2016-06-30
    Keywords: ddc:080
    Language: German
    Type: masterthesis , doc-type:masterThesis
    Format: application/pdf
    Format: application/pdf
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 6
    Publication Date: 2020-08-05
    Keywords: ddc:080
    Language: English
    Type: masterthesis , doc-type:masterThesis
    Format: application/pdf
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 7
    Publication Date: 2020-08-05
    Description: In dieser Diplomarbeit werden grundlegende Probleme der kostenoptimalen Dimensionierung von Telekommunikationsnetzwerken untersucht. Diese werden als lineare gemischt ganzzahlige Programme formuliert, wobei sich in der Modellierung auf die Konzepte Routing und Kapazitätszuweisung beschränkt wird. Es werden parallel drei übliche, aus der Praxis motivierte Möglichkeiten behandelt, die auf gerichteten oder ungerichteten Kanten eines Netzwerkes installierte Kapazität zu nutzen. Diese unterscheiden wir als DIrected, BIdirected und UNdirected. Die studierten Probleme treten als Relaxierungen vieler realistischer Fragestellungen der Netzwerkoptimierung auf. Sie enthalten elementare Strukturen, deren Studium ausschlaggebend ist für das Verständnis komplexerer Modelle. Letztere können zusätzliche Erfordernisse berücksichtigen, wie zum Beispiel die Ausfallsicherheit von Netzwerken. Zur Lösung solcher NP-schweren Optimierungsprobleme werden erfolgreich Branch & Bound und Schnittebenenverfahren kombiniert (Branch & Cut). Für die Wirksamkeit dieser Algorithmen ist es sehr nützlich, möglichst genaue Kenntnisse der Struktur der Seitenflächen der zugrundeliegenden Polyeder zu haben, welche die konvexe Hülle der Lösungsmenge beschreiben. Es sind starke gültige Ungleichungen zu finden, welche hochdimensionale Seitenflächen oder sogar Facetten definieren. Diese sollten zudem schnell separiert werden können und die numerische Stabilität der Algorithmen möglichst nicht beeinflussen. Diese Arbeit beschäftigt sich im Wesentlichen mit der sehr allgemeinen Rundungstechnik Mixed- Integer Rounding (MIR) zur Verstärkung gültiger Ungleichungen unter Verwendung der Ganzzahligkeitsnebenbedingungen. Es wird eine MIR-Prozedur motiviert, bestehend aus den Schritten Aggregieren, Substituieren, Komplementieren und Skalieren, welche durch Ausnutzung der Struktur der gegebenen Parameter zu einer gültigen Basisungleichung führt, die dann durch MIR eine starke und oft facetten-induzierende Ungleichung gibt. Es werden verschieden Klassen solcher Ungleichungen untersucht und auf ihre Praxistauglichkeit beim Einsatz in Branch & Cut-Verfahren getestet. Nach einer kurzen Einführung werden in Kapitel 2 die für uns in dieser Diplomarbeit relevanten Probleme definiert. Kapitel 3 gibt eine ausführliche Übersicht über die Technik MIR.Wir beschäftigen uns vor allen Dingen mit den Begriffen Superadditivität und Lifting und behandeln Aspekte wie Numerik und beschränkte Variablen. Kapitel 4 und Kapitel 5 umfassen Untersuchungen zu so genannten cut sets. Diese Polyeder werden durch Schnitte in Netzwerken definiert und relaxieren die von uns behandelten Probleme. Hauptsächlich durch MIR entwickeln wir sowohl neue als auch bekannte Klassen von facetten-definierenden Ungleichungen für cut sets, wobei strukturelle Unterschiede herausgearbeitet werden, die durch die drei verschiedenen Typen der Kapzitätsbereitstellung und durch beschränkte Variablen entstehen. Als ein zentrales Resultat wird bewiesen unter welchen Bedingungen facetten-induzierende Ungleichungen für cut sets auch Facetten der zugehörigen relaxierten Polyeder sind. Im Kapitel 6 geben wir weitere Typen von MIR-Ungleichungen an, die auf anderen Netzwerkstrukturen basieren und weisen ferner auf offene Fragen sowie interessante Ideen hin. Das Kapitel 7 widmet sich schließlich der Entwicklung und Implementation von Separationsalgorithmen. Wir testen einige der entwickelten Ungleichungsklassen mit Hinblick auf Ihre Wirksamkeit zur Lösung von realistischen Problemen der Netzwerkdimensionierung aus der Telekommunikation und diskutieren die Ergebnisse.
    Keywords: ddc:080
    Language: German
    Type: masterthesis , doc-type:masterThesis
    Format: application/pdf
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 8
    Publication Date: 2016-06-30
    Description: Diese Arbeit dokumentiert den Entwurf und die Implementierung einer NFS-Schnittstelle zum ZIBDMS. Das ZIBDMS, welches derzeit am Zuse-Institut Berlin entwickelt wird, ist ein Managementsystem für verteilte Daten in heterogenen Umgebungen [10]. Es soll die einfache Benutzung von Mechanismen zur Replikation sowie neue Möglichkeiten des Zugriffs und der Verwaltung von Metadaten und Datenobjekten ermöglichen. Dem Nutzer bietet das System verschiedene Sichten: Neben der klassischen, hierarchischen Sicht mit Verzeichnissen und Dateien wird auch eine attributbasierte Zugriffsmethode angeboten, in der Datenobjekte ausschließlich über Attribut/Wert-Paare referenziert werden. Für den Benutzer transparent, soll sich das System im Hinblick auf die Verfügbarkeit von Daten und Metadaten selbsttätig optimieren. Um Skalierbarkeit gew¨ahrleisten zu können, werden intern Peer-to-Peer- Techniken entwickelt und benutzt. Die NFS-Schnittstelle erhöht die Nutzbarkeit des Systems, da Client- Implementierungen für nahezu alle Betriebssysteme zur Verfügung stehen. Der Benutzer kann so über das gewohnte Dateisystem Daten und Metadaten pflegen, ohne spezifisches Vorwissen zu benötigen. In dieser Arbeit wird untersucht, inwiefern sich die Semantik des ZIBDMS auf jene des NFS-Protokolls übertragen läßt. Weiterhin wird das Konzept von Pseudodateien beschrieben und diskutiert, inwiefern es eine brauchbare Lösung darstellt, den im Vergleich zur NFS-Semantik wesentlich größeren Funktionsumfang des ZIBDMS für den Anwender nutzbar zu machen. Pseudodateien sind nicht-persistente Objekte, welche für den Benutzer als reguläre Datei sichtbar werden und die erweiterte Funktionalitäten wie die Bearbeitung von Metadaten oder die Platzierung von Replikaten über die Dateisystem-Sicht des NFS zur Verfügung stellen sollen. Schließlich werden Leistungsmessungen an den benutzten Komponenten des ZIBDMS vorgenommen und vergleichbaren Systemen gegen übergestellt. Die Aufmerksamkeit liegt hier auf der zugrundeliegenden Katalog-Technologie sowie dem durch das NFS-Protokoll verursachten Overhead.
    Keywords: ddc:080
    Language: German
    Type: masterthesis , doc-type:masterThesis
    Format: application/pdf
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 9
    ISSN: 1573-5060
    Keywords: transformation ; silicon carbide ; whiskers ; maize
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Agriculture, Forestry, Horticulture, Fishery, Domestic Science, Nutrition
    Notes: Summary We review here the most recently developed technique for maize transformation which involves the vortexing of silicon carbide whiskers with maize cells in the presence of plasmid DNA. Fertile transgenic plants have been regenerated following whisker-mediated transformation which is compared with the alternatives described to date, namely protoplast uptake, particle bombardment and electroporation of intact tissue.
    Type of Medium: Electronic Resource
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 10
    ISSN: 1573-5060
    Keywords: Bacillus thuringiensis ; maize ; microprojectile bombardment ; transformation
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Agriculture, Forestry, Horticulture, Fishery, Domestic Science, Nutrition
    Notes: Summary A synthetic Bt gene encoding a truncated version of the CryIA(b) protein derived from Bacillus thuringiensis was successfully introduced into elite maize using microprojectile bombardment of immature embryos. The method used to initiate and identify transformation events is described. We describe the detailed parameters used for the Biolistics device as well as the plasmids used for the transformations. The plasmids contained the synthetic Bt gene driven by either the 35S CaMV promoter or a combination of two tissue-specific promoters, leaf and pollen, derived from maize. Specific conditions for the culture of Type I callus from immature embryos, the phosphinothricin (PPT) selection protocol, and the regeneration of plants are discussed. T0 and T1 plants were initially identified using the pH-dependent chlorophenol red test and/or the histochemical β-glucuronidase (GUS) assay. PCR and Southern data confirm the presence of the 35S CaMV promoter and the synthetic Bt gene.
    Type of Medium: Electronic Resource
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 11
    ISSN: 1573-5060
    Keywords: Agrobacterium tumefaciens ; electroporation ; particle gun ; polyethylene glycol ; regeneration ; transformation
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Agriculture, Forestry, Horticulture, Fishery, Domestic Science, Nutrition
    Notes: Summary Suitable sunflower tissues and cells were transformed either by direct gene transfer into protoplasts, particle bombardment, or Agrobacterium co-culture. While all techniques allowed efficient short-term or transient expression of the introduced gene(s) in the respective tissues, stable transformation was only observed after transformation with Agrobacterium. The latter technique was suitable for the production of transgenic callus from seedling cotyledons and occasional shoots with chimaeric expression of the transgene. Detailed analysis of the interaction of Agrobacterium with this explant showed that infection efficiency was critically dependent on the co-culture conditions, and that the preferentially-transformed cells were not the ones competent for regeneration.
    Type of Medium: Electronic Resource
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 12
    ISSN: 1573-5060
    Keywords: Agrobacterium ; transformation ; lily ; β-glucuronidase
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Agriculture, Forestry, Horticulture, Fishery, Domestic Science, Nutrition
    Notes: Summary Lily cv. Harmony was inoculated with several Agrobacterium strains to study its susceptibility to Agrobacterium infection and transformation. Tumorous tissue formation on inoculated stem internodes of sterile-grown plantlets, as well as expression of a β-glucuronidase marker gene interrupted by an intron in cells of inoculated stem nodes, indicate that the monocotyledon Lilium is a host for Agrobacterium.
    Type of Medium: Electronic Resource
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 13
    ISSN: 1573-5060
    Keywords: Hordeum vulgare ; isolated microspores ; particle bombardment ; transformation
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Agriculture, Forestry, Horticulture, Fishery, Domestic Science, Nutrition
    Notes: Summary A highly regenerable, isolated microspore system for barley, Hordeum vulgare L. cv. Igri, has been developed which is amenable to transformation studies using particle bombardment. The system allows DNA to be delivered to microspores at the single cell stage and both transient and stable transformation events have been demonstrated. The potential advantages of using isolated microspores as the target tissue in routine transformation systems are discussed.
    Type of Medium: Electronic Resource
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 14
    ISSN: 1573-5060
    Keywords: Lycopersicon ; tomato ; tomato spotted wilt virus ; tospovirus ; transformation ; virus resistance
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Agriculture, Forestry, Horticulture, Fishery, Domestic Science, Nutrition
    Notes: Summary Tomato spotted wilt virus (TSWV) causes significant economic losses in the commercial culture of tomato (Lycopersicon esculentum Mill.). Culture practices and introgression of natural sources of resistance to TSWV have only been marginally effective in controlling the TSWV disease. Recently however, high levels of protection against TSWV have been obtained by transforming tobacco with a chimaeric gene cassette comprising the TSWV nucleoprotein gene. This report demonstrates the successful application of this newly-created TSWV resistance gene in cultivated tomato. Transformation of an inbred tomato line with the TSWV nucleoprotein gene cassette resulted in high levels of resistance to TSWV that were maintained in hybrids derived from the parental tomato line. Therefore, transformant lines carrying the synthetic TSWV resistance gene make suitable progenitors for TSWV resistance to be incorporated into the breeding programmes of tomato.
    Type of Medium: Electronic Resource
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 15
    ISSN: 1573-5060
    Keywords: Agrobacterium ; plant regeneration ; potato ; Solanum tuberosum ; tissue culture ; transformation
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Agriculture, Forestry, Horticulture, Fishery, Domestic Science, Nutrition
    Notes: Summary To provide a truly genotype-independent transformation system, it is necessary to be able to transform a wide range of potato genotypes. The ability to regenerate shoots in vitro was determined for 34 potato varieties using tuber disc explants. Following a culture regime used extensively in previous studies with the variety Desiree, half of the varieties could be regenerated from tuber discs and half could not. From a sample of varieties that could be regenerated from tuber discs, all but one variety gave transgenic plants. Twelve varieties were evaluated for the capacity to regenerate shoots from leaf and internode explants excised from in vitro grown plants. All of the varieties tested regenerated adventitious shoots. Leaf and internode explants from 5 varieties were subsequently used for transformation, and transgenic plants were produced from two potato varieties that did not give transgenic plants from tuber disc explants. Some varieties could not be transformed by either method, and will require modification of the in vitro regeneration and transformation system to be successful.
    Type of Medium: Electronic Resource
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 16
    Electronic Resource
    Electronic Resource
    Springer
    Euphytica 85 (1955), S. 131-134 
    ISSN: 1573-5060
    Keywords: apple ; transformation ; Agrobacterium ; preculture ; azacytidine
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Agriculture, Forestry, Horticulture, Fishery, Domestic Science, Nutrition
    Notes: Summary Leaf explants of apple cvs Gala and Golden Delicious were infected with the Agrobacterium tumefaciens strain AGL0(pMOG410). The effects of a 2 d preculture of the explants before infection and the addition of 5-azacytidine to the selection medium were studied. The percentages of GUS-positive explants after 5 w did not significantly alter due to these treatments. One of the ‘Gala’ shoots, which was removed from a leaf explant cultured for 8 w on selection medium, proved to be GUS-positive and will be analyzed further. In general, however, it should be concluded that regeneration of transgenic shoots directly from leaf tissue was not very effective.
    Type of Medium: Electronic Resource
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 17
    ISSN: 1573-5060
    Keywords: Brassica napus ; disease tolerance ; oxalic acid ; oxalate oxidase ; Sclerotinia sclerotiorum ; transformation
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Agriculture, Forestry, Horticulture, Fishery, Domestic Science, Nutrition
    Notes: Summary Oxalic acid is thought to have a primary role in the pathogenicity of several plant pathogens, notably Sclerotinia selerotiorum. A gene coding for the enzyme oxalate oxidase was isolated from barley roots and introduced into oilseed rape as a means of degrading oxalic acid in vivo. This report describes the production of several transgenic plants of oilseed rape and the characterisation of these plants by Southern, Western and enzyme activity assays. Plants were shown to contain an active oxalate oxidase enzyme and were tolerant of exogenously supplied oxalic acid.
    Type of Medium: Electronic Resource
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 18
    Electronic Resource
    Electronic Resource
    Springer
    Euphytica 85 (1955), S. 1-12 
    ISSN: 1573-5060
    Keywords: genetic engineering ; gene targets ; mapping ; markers ; transformation ; QTLs
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Agriculture, Forestry, Horticulture, Fishery, Domestic Science, Nutrition
    Type of Medium: Electronic Resource
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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  • 19
    ISSN: 1573-5060
    Keywords: alfalfa ; alpha-amylase ; field performance ; manganese-dependent lignin peroxidase ; Medicago sativa ; transformation
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Agriculture, Forestry, Horticulture, Fishery, Domestic Science, Nutrition
    Notes: Summary Transgenic alfalfa plants expressinBacillus licheniformis alpha-amylase and mangaese-dependent lignin peroxidase (Mn-P) from Phanerochaete chrysosporium were produced using the Agrobacterium tumefaciens transformation system. In each case, there was a range of expression of the introduced gene among independent transgenic plants. Plants producing alpha-amylase showed no alteration of phenotype. Production of Mn-P in alfalfa, howeven, in most cases adversely affected plant growth and development. Affected plants were stunted with yellowing foliage, but survived and produced seed. Results from field trials showed that Mn-P production in transgenic alfalfa reduced dry matter yield and plant height. The extent of these symptoms and yield reduction was, for the most part, related to the level of foreign protein production as estimated by Western analysis. Field data from transgenic plants expressing alpha-amylase showed that there was no effect of foreign protein production on plant performance. Expression of Mn-P was shown to segregate in sexual progeny derived from transgenic plants.
    Type of Medium: Electronic Resource
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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